bioinformatics-algorithms

【文件属性】：
文件名称：bioinformatics-algorithms
文件大小：180KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-25 23:59:39
Python 代码挑战：实施BWMATCHING。 输入：字符串BWT（Text），后跟一组模式。 输出：一个整数列表，其中第i个整数对应于文本中Patterns的第i个成员的子字符串匹配数。 额外数据集 样本输入：TCCTCTATGAGATCCTATTCTATGAAACCTTCA $ GACCAAAATTCTCCGGC CCT CAC GAG CAG ATC样本输出：2 1 1 0 1 代码挑战：实现更好的匹配。 输入：字符串BWT（Text），后跟字符串模式的集合。 输出：一个整数列表，其中第i个整数对应于文本中Patterns的第i个成员的子字符串匹配数。 额外数据集 样本输入：GGCGCCGC $ TAGTCACACACGCCGTA ACC CCG CAG样本输出：1 2 1 时限：5分钟 代码挑战：解决多模式匹配问题。 输入：字符串文本，后跟字符串模式的集合。 输出：Text中所有

【文件预览】：
bioinformatics-algorithms-master
----rear.py(1KB)
----evolution.py(39KB)
----prot.py(2KB)
----iprb.py(147B)
----test~(49B)
----second_seq(1KB)
----lcsm.py(726B)
----dna.py(269B)
----rna.py(170B)
----iev.py(105B)
----fibo.py(214B)
----289_5(218KB)
----lgis.py(1KB)
----practice.py(8KB)
----third_seq(1KB)
----bins.py(667B)
----test(121KB)
----grph.py(375B)
----pper.py(369B)
----craig.py(5KB)
----287_4(54KB)
----compareString.py(12KB)
----revp.py(587B)
----lexf.py(435B)
----tran.py(482B)
----result(2KB)
----gc.py(420B)
----kmer.py(341B)
----cluster.py(7KB)
----combinatorial.py(7KB)
----cons.py(950B)
----cons(8KB)
----fibd.py(394B)
----lexf(3KB)
----fib.py(221B)
----sseq.py(350B)
----third(186B)
----BLOSUM62.txt(1KB)
----revc.py(401B)
----mmch.py(421B)
----sign.py(516B)
----README.org(19KB)
----kmer(0B)
----tree.py(1009B)
----bwa.py(5KB)
----seq_seq(1KB)
----splc.py(2KB)
----lcsq.py(713B)
----perm.py(289B)
----hamm.py(228B)
----hmm.py(29KB)
----second(199B)
----edit.py(611B)
----seq(397B)
----grph(4KB)
----edta.py(1KB)
----proteomics.py(13KB)
----first(0B)
----pmch.py(692B)