文件名称:vigilante:可视化链接和嵌套翻译中的集成基因组学,并通过统计了解基因组假设中的数字
文件大小:965KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-02 12:10:07
R
治安与骑士 可视化链接和嵌套翻译中的集成基因组学,并通过统计了解基因组假设中的数字 Vigilante&Knights的目标是通过授权研究人员对他们的全基因组/外来体测序(WGS)进行复杂的,基于尖端信息学的分析,从而促进高通量下一代测序(HT-NGS)研究中的数据分析和可视化。 / WES)和RNA-seq数据在交互式开源环境中,并具有用于评估生物事件的统计模块。 此外,“守夜人与骑士”以高度独立的流水线风格工作,即使对于没有太多编程经验的非信息学研究人员,其设计也易于使用。 安装 目前, vigilante&knights的官方R包版本正在重新配置中,可以从GitHub上通过以下方式安装vigilante&knights的开发版本(分阶段发行): devtools :: install_github( " yilixu/vigilante " , ref = " main " )
【文件预览】:
vigilante-main
----.DS_Store(8KB)
----NAMESPACE(470B)
----README.html(1.13MB)
----vigilante.Rproj(386B)
----DESCRIPTION(2KB)
----R()
--------.DS_Store(6KB)
--------module_DESeq2.R(0B)
--------module_SSE.R(0B)
--------module_PWC.R(0B)
--------module_CSE.R(0B)
--------module_xCell.R(59KB)
--------module_GlobalSettings.R(29KB)
--------module_IGV.R(0B)
--------module_LLP.R(0B)
--------module_TCGA.R(0B)
--------module_Circos.R(51KB)
--------module_MuSiCa.R(0B)
--------module_CHM_G.R(91KB)
--------module_CHM_T.R(62KB)
----.Rbuildignore(78B)
----LICENSE(37B)
----LICENSE.md(1KB)
----README.md(3KB)
----man()
--------figures()
--------v_Circos.Rd(4KB)
--------v_prepareVdata_CHM_T.Rd(4KB)
--------v_chmFoldChangeLog10_xCell.Rd(507B)
--------.DS_Store(6KB)
--------v_prepareVdata.Rd(654B)
--------v_chmSignaturePanel.Rd(12KB)
--------v_chmXcell.Rd(9KB)
--------v_chmRiskScore.Rd(728B)
--------v_prepareVdata_Circos.Rd(4KB)
--------v_magick_chm.Rd(615B)
--------v_magick_xCell.Rd(467B)
--------v_chmTranscript.Rd(8KB)
--------v_chmFoldChangeLog10.Rd(623B)
--------v_prepareVdata_xCell.Rd(2KB)
--------v_prepareVdata_CHM_G.Rd(2KB)
--------v_globalSettings.Rd(9KB)
--------v_chmTPM2RHKG.Rd(714B)
----.gitignore(29B)
----README.Rmd(3KB)