文件名称：UMAMI
文件大小：20.26MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-26 13:58:30
Clarion
UMAMI运输机功能表征 任务： 拉詹： 在拟南芥中获取UMAMI基因 从bioMart获取蛋白质序列 针对小麦基因组的蛋白质爆炸：评估值截断了1e-10 后期处理：每个拟南芥UMAMI基因的前10个小麦基因（总共129个基因） 获取选定小麦基因的核苷酸序列 每个拟南芥UMAMI基因与其前10个小麦blastp匹配的基于肌肉的多序列比对（MSA），邻域连接系统树（以编程方式使用EBI REST API） 使用NGphylogeny.fr组合的所有小麦和拟南芥UMAMI基因的最大似然系统树。 使用Elu上的ClustalΩ对所有序列进行MSA比对并生成系统发育树 基于蛋白质域的搜索：识别拟南芥UMAMI基因中的突出IPR和PF域 使用突出的interpro（IPR）域搜索其他潜在的UMAMI基因（结果为205个潜在的UMAMI基因） 在《科学》小麦基因组论文中搜索高可