warbler_inversions

时间:2024-04-17 18:11:45
【文件属性】:

文件名称:warbler_inversions

文件大小:35KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-17 18:11:45

Perl

warbler_inversions 这是“反转保持鸣禽的迁徙表型之间的差异”中使用的工作流和脚本的集合。


【文件预览】:
warbler_inversions-main
----scripts()
--------add_snp_id_from_other_vcf.pl(1KB)
--------summarize_annotation_data.pl(11KB)
--------extract_ref_pos_snps_array_gmap_coords.pl(879B)
--------get_gaps_in_supercontigs_from_bionano_scaffolding.pl(1KB)
--------summarize_gene_models_synteny_intersect.pl(7KB)
--------summarize_interpro_output.pl(1KB)
--------parse_reciprocal_blast_data.pl(4KB)
--------extract_longest_aug_transcript.pl(1KB)
--------get_supercontigs_from_bionano_scaffolding.pl(1KB)
--------augustus_training_workflow.sh(5KB)
--------change_gene_names_aug_models_gff3.pl(2KB)
--------collect_info_from_augustus_gff.pl(3KB)
----README.md(158B)
----workflows()
--------dating_analyses.md(4KB)
--------annotation.md(14KB)
--------breakpoint_analyses.md(9KB)
--------resequencing_variant_calling.md(28KB)
--------genome_assemblies.md(19KB)

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