文件名称：LiME_binning
文件大小：16KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-16 11:42:39
C++
LiME_binning LiME_binning是一种新颖的轻量级的无对齐和无汇编的宏宏分箱框架，该框架本质上是组合的，允许我们使用很少的内部存储器。 令S为包含读数的大量生物序列的集合。 它接受输入： 集合S的最长公共前缀数组（lcp）； 集合S的文档数组（da）。 安装 git clone https://github.com/saramont/LiME_binning cd LiME_binning 编译 make 跑步 ./ 例子 ./ 参考： 学位论文 @thesis{thesisMontemaggi, author = {Sara Montemaggi}, title = {Nuovo approccio per il binning di frammenti di DNA: teoria ed esperimenti},
【文件预览】：
LiME_binning-main
----src()
--------ClusterLCP.cpp(9KB)
--------Tools.h(3KB)
--------BinningDA.cpp(25KB)
--------modifyDA.cpp(2KB)
--------INFO.txt(15B)
--------Validation.cpp(4KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(1KB)
----makefile(816B)