【文件属性】:
文件名称:减去图像均值matlab代码-HeALTH_Tracker:健康系统行为分析代码
文件大小:8.24MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-06-03 20:59:33
系统开源
热图像均值matlab代码健康追踪器
HeALTH
系统行为分析代码
HeALTH_Tracker
包括用于分析来自
HeALTH
平台的行为数据的
MATLAB
文件。
选择包含感兴趣的视频的文件夹后,代码将从设备内每个选定的感兴趣的蠕虫中纵向提取寿命数据和行为特征。
此外,在分析了每个个体群体后,用户可以选择性地将试验一起编译(基于实验条件),并根据需要执行额外的下游行为分析。
注意:由
Stephen
Cobeldick
创建的
alphanumericSortFiles(版权所有
(c)
2018)
最后更新:11/1/19
文件
generalManager.m
主文件处理程序
('generalManager.m')
调用获取生命周期数据和从视频中提取行为指标所需的所有函数。
根据用户需要,可以根据需要注释掉某些部分。
用户将从这里选择要分析的视频数据集。
getChamberLocations
此文件夹/子文件识别要在设备中分析的蠕虫,并通过互相关获取所选文件夹中设备所有文件的腔室中心位置,以执行自动腔室识别。
它包含
roomLocator.m(文件夹中的“main”函
【文件预览】:
HeALTH_Tracker-master
----generalManager.m(5KB)
----importVideo.m(677B)
----getCroppedImg.m(1KB)
----getChambersLocations()
--------createChamberMask.m(4KB)
--------checkCenters.m(2KB)
--------roomLocator.m(7KB)
--------getChamberCenters.m(1KB)
----HeALTH_LabVIEWGUI.zip(12.78MB)
----structContains.m(158B)
----alphanumericSortFiles()
--------natsort.m(13KB)
--------natsortfiles.m(6KB)
--------license.txt(1KB)
----behavioralAnalysis()
--------compareBehaviors.m(2KB)
--------regressionModel.m(5KB)
--------combinedRelativeBehavioralDecline.m(5KB)
--------plottingBehavioralParameters.m(11KB)
----README.md(5KB)
----getBehavior()
--------SimpleEndpoints.m(2KB)
--------freqFixer_DELETE.m(6KB)
--------plotBodyMovement.m(2KB)
--------getBehaviorParameters.m(11KB)
--------combMovDataHandler_DELETE.m(2KB)
--------getLine.m(4KB)
--------deathVids_comb.mat(117KB)
--------getMovementReadouts.m(24KB)
--------getBehavior.m(12KB)
--------calculateTangentsFromBackbone.m(2KB)
--------getAmplitude.m(699B)
--------getBodyLineVelocity.m(2KB)
----backgroundSubtraction.m(148B)
----getPixelChanges()
--------pixelChange.m(17KB)
--------motionStabilization.m(1KB)
----getSegmentedWorms()
--------findWorm.m(11KB)
--------getExpectedSizes.m(709B)
--------hotelManager.m(7KB)
--------circleMe.m(339B)
--------segWorm.m(3KB)
--------getSeasonStats.m(9KB)
--------getThreshold.m(6KB)
--------getWormStrel.m(654B)
--------getGradientField.m(1KB)
--------findWormWrapper.m(5KB)
--------evalExpectations.m(3KB)
--------getExpectedIntensity.m(207B)
--------getWidthVals.m(222B)