文件名称：用matlab运行MD5代码-vPECA-:vPECA-
文件大小：7.16MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-07 00:23:09
系统开源
用matlab运行MD5代码vPECA vPECA 是一种通过配对表达和染色质可及性数据的变体解释方法，可以识别活性和活性选择的调控元件及其基因调控网络。 1. 数据可用性 “高海拔缺氧适应的染色质可及性景观和调控网络”中的数据组织具有三个基本组成部分。 (1) 元数据电子表格 Summay_info_of_HUVEC_data.xlsx 中提供了元数据电子表格，其中包含四个子表格，即 NGS、RNA-seq、ATAC-seq 和 Hi-C。 元数据是指关于整个研究、单个样本、所有协议以及对已处理和原始数据文件名的引用的描述性信息。 通过填写元数据模板电子表格的所有字段来提供信息。 电子表格中提供了有关每个字段内容的指南。 使用的参考程序集 (hg19) 在元数据电子表格中提供。 (2) 原始数据 原始数据文件是包含读数和质量分数的原始文件，由 Illumina 测序仪器生成。 原始数据文件格式为 FASTQ。 我们为所有数据文件提供 MD5 校验和。 校验和用于验证文件完整性。 本研究中产生的所有 RAW 数据和处理过的数据都已永久保存在 GSA 数据库中，项目 ID 为 PRJCA
【文件预览】：
vPECA--master
----estimate_selection.m(3KB)
----estimate_selection_parameter.m(525B)
----TGfun.m(1KB)
----README.md(5KB)
----Data()
--------Symbol.txt(73KB)
--------HUVEC_FPKM.txt(4.38MB)
--------element_SNP_use.txt(14.75MB)
--------Element_name.txt(1.19MB)
--------main_vPECA.m(4KB)
----main_vPECA.m(5KB)
----alphabetagama2.m(3KB)
----test.m(2KB)
----coeff_t_test.m(336B)
----Summay info of HUVEC data.xlsx(22KB)