文件名称：matlab代码sqrt-brainbowSegmentation:脑弓分割
文件大小：153KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 15:34:36
系统开源
Matlab代码sqrt 欢迎 概述 运行mainScript.m 有关此方法的基础知识的演示可在此处获得： denoisingScript：去噪脑弓堆栈 superVoxelizationScript：切换到过度分段的“ supervoxel”表示形式 colorKmeans：基于颜色（LUV空间）的k均值聚类 computeNormalizedCuts_mem：超体素的半监督归一化分割分割 handleClusters：集群级操作（人机交互），为半监督的图割提供集群种子，即合并，拆分，清理 keepLargeClumps：仅当超体素子集形成足够大的连接组件（人类交互）以提供用于半监督图割的簇种子时，才保留它们。 可视化：包括可视化和文件写入脚本的目录 segProjectionWrite_script：脚本可在一幅大的2d图像中可视化所有群集的最大强度z投影。 segProjectionWrite_scriptXYZ：脚本可在一幅大的2d图像中可视化所有群集的最大强度x，y和z投影。 write3dTifForIndividualComponents_script：生成3d tif
【文件预览】：
brainbowSegmentation-master
----splitInconsistentSuperVoxels.m(5KB)
----mergeSupervoxels.m(6KB)
----writeProjectedSegmentationScript.m(2KB)
----topologyPreservingVolumeShrinkerWithPreference6.m(6KB)
----calculateOrientations.m(2KB)
----reportConfusionsAndRI.m(2KB)
----tempQscript.m(5KB)
----spatialAffinityBetweenObjectPairForLargeObjects.m(1KB)
----mainScript.m(4KB)
----cutDendrogram.m(3KB)
----colorInitializedWeightedKmeans.m(4KB)
----mergeSmallSuperVoxels.m(4KB)
----calculate_sAff.m(5KB)
----irbleigs.m(64KB)
----mergeClusters.m(2KB)
----supervoxelize.m(12KB)
----README.md(6KB)
----segmentImage.m(4KB)
----OLD()
--------scMergerOnSubgraph.m(3KB)
--------iterativeSpatioTemporalSupervoxelMerger.m(4KB)
--------graphSupervoxelMergerWithMSSVandMSNSV.m(4KB)
--------mergeSupervoxels.m(10KB)
--------nCutsForSCMerging.m(3KB)
--------graphSupervoxelMerger.m(3KB)
--------removeSmallComponents.m(2KB)
--------calculateNormalizedCuts_mem.m(10KB)
--------denoisingScript.m(625B)
--------spatialAffinityBetweenObjectPairForLargeObjects.m(1KB)
--------simple_fkmeans.m(8KB)
--------mergeConnComp2.m(5KB)
--------mainScript.m(4KB)
--------weightedKernelKMeans.m(1KB)
--------splitHardSuperVoxels_kmeansNB.m(5KB)
--------netLasso()
--------license_distinguishable_colors.txt(1KB)
--------superVoxelizationScript.m(7KB)
--------mergeSubgraphs2.m(4KB)
--------colorKmeans.m(677B)
--------reconstruct1neuron.m(3KB)
--------mergeConnComp3.m(4KB)
--------mergeSmallSuperVoxels.m(3KB)
--------calculate_sAff.m(5KB)
--------distinguishable_colors.m(6KB)
--------mergeConnectedComponentsWithinIndividualClusters.m(4KB)
--------supervoxelize2.m(9KB)
--------ss_fkmeans.m(8KB)
--------irbleigs.m(64KB)
--------analytics()
--------splitHardSuperVoxels.m(4KB)
--------randomlyPartitionBinaryGraph.m(2KB)
--------vdpgm_countEstimate.m(273B)
--------manipulateClusters.m(2KB)
--------calculateNormalizedCuts.m(2KB)
--------supervoxelize.m(8KB)
--------README.md(5KB)
--------demixSupervoxels5.m(5KB)
--------mergeConnComp4.m(5KB)
--------segmentImage.m(4KB)
--------retainLargeClumps.m(1KB)
--------spatialAffinityBetweenObjectPair.m(346B)
--------mergeSingleNeighborSuperVoxels.m(4KB)
--------denoise_BM4D.m(301B)
--------segmentImage2.m(4KB)
--------rgb2luv.m(1KB)
--------graphSupervoxelMergerWithMSSV.m(4KB)
--------newSplitHardSuperVoxels.m(5KB)
--------fkmeans.m(7KB)
--------showIndividualSuperVoxels.m(465B)
--------assign6Boundaries.m(2KB)
--------generateAffinityMatrix.m(6KB)
--------singleNeuronReconstruction.m(2KB)
--------generateAffinityMatrix2.m(6KB)
--------mainScript2.m(5KB)
--------newMergeWRTneighborsAndOrientations.m(5KB)
--------visualization()
--------calculateGraphAffinity.m(9KB)
--------luv2rgb.m(1KB)
----mergeCloseNeighborhoods.m(3KB)
----mergeSingleNeighborSuperVoxels.m(3KB)
----rgb2luv.m(1KB)
----mergeWRTneighborsAndOrientations.m(5KB)
----demixSupervoxels.m(6KB)
----assign6Boundaries.m(2KB)
----generateAffinityMatrix.m(5KB)
----timingNotes.txt(10KB)
----removeSmallSupervoxels.m(1KB)
----luv2rgb.m(1KB)