文件名称：CliHelpParser:读取CLI帮助命令的输出，并生成机器可读的模式（CWL等）
文件大小：1.71MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-31 00:42:45
cli parser workflow bioinformatics pipeline
气候 有关完整文档，请参阅。 aCLImatise是一个Python库和命令行实用程序，用于解析命令行工具的帮助输出，然后以更结构化的格式（例如，输出该工具的说明。 当前，aCLImatise支持和输出，但是将来会考虑其他格式，尤其是请求支持它们的请求。 另请参阅 ，这是由aCLImatise解析器生成的预先计算的工具定义的数据库。 大多数生物信息学工具都已经在Base Camp中生成了工具定义，因此您可能无需直接运行aCLImatise。 aCLImatise现在发表在《生物信息学》杂志上。 您可以在这里阅读应用说明： : 。 要引用文献，请使用期刊提供的引文生成器。 例子 假设您要创建一个包含通用Unix wc （字数统计）实用程序的CWL工作流程。 运行wc --help返回： Usage: wc [OPTION]... [FILE]... or: wc [OPT