【文件属性】:
文件名称:SMRT:使用SMRT数据进行SNP调用和单倍型装配的渐进方法
文件大小:19.63MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-04-29 00:24:30
使用SMRT数据进行SNP调用和单倍型装配的渐进方法
1.数据
SMRT数据:NA12878 NA24385
参考:人类参考基因组序列GRCh37
dbsnp:dbSNP发布内部版本138数据
2.结果
模拟与真实:NA12878和NA24385的1号染色体
3.代码
运行.jar
参数:
长读取数据(块)文件路径
参考文件路径
SNP数据库文件路径
结果文件夹路径
染色体ID
【文件预览】:
SMRT-master
----info.snp(592B)
----group.mtx(90B)
----example.zip(2.08MB)
----block.sam(6.21MB)
----run.class(81KB)
----correction.mtx(89KB)
----simulate.zip(15.96MB)
----README.md(435B)