PCR-detective:最后的项目为4050

时间:2024-04-16 20:10:55
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文件名称:PCR-detective:最后的项目为4050

文件大小:6KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-16 20:10:55

Python

PCR检测 我们的目标: 在这个项目中,我们正在尝试创建一种轻量级的开源工具,供科学家在PCRReact之前或引物设计期间进行核酸序列分析和纯化。 我们的工具将支持从常规PCR到rt-qPCR的多种PCR。 我们的工具将验证(并在用户需要时清理)将要分析的序列的输入,并返回可能在实验中引起麻烦的问题列表,例如引物之间的独特Tm差异,RNA模板中复杂的二级结构以及错误的启动。 依赖关系: Biopython版本1.78 在发展中 我们已经成功运行了readfile模块,并且cleanup模块正在开发中,并有望在不久的将来成为现实。 要使用readfile模块,只需安装biopython软件包并运行代码。 您也可以从模块readfile导入read_file类,并使用 file = read_file('filepath') seq_tuple = file.readfile() 输入将是


【文件预览】:
PCR-detective-main
----paired-programming.md(1KB)
----src()
--------readfile.py(1KB)
--------__init__.py(158B)
--------cleanup.py(2KB)
--------__main__.py(952B)
----proposal.md(2KB)
----setup.py(413B)
----README.md(1KB)
----data()
--------sequence.fasta(165B)

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