yipCat:yipCat包实现一些功能工具

时间:2024-04-23 07:29:20
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文件名称:yipCat:yipCat包实现一些功能工具

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更新时间:2024-04-23 07:29:20

R

yipCat 描述 YipCat软件包可以实现一些更常用的转录分析要求,例如轨迹分析,热图,单元格相互作用,抗权重,cellphonedb,agecore等,您可以在软件包内部查看功能说明。 主要是该图的实现样式要更高级地看一下,特别是质谱流数据也已经集成并且可以实现细胞定位仪cloupe文件的交互,非常方便。 安装 您可以通过以下命令安装此软件包: install.packages( " yipCat_1.0.1.tar.gz " ) 要求 require( Seurat ) require( dplyr ) require( ggplot2 ) require( S4Vectors ) require( nabor ) ... 弹道 样条轨迹的实现,具体方法描述主要借鉴了部分ArchR方法,示意图如下: 您可以通过以下命令来计算trajecory seurat <- addSeu


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