文件名称：SuffixTree:McCreight后缀树构建算法的实现
文件大小：857KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-04 11:23:05
C++
后缀树构造 建造 运行make 。 跑步： $ ./suffix input.fasta alphabet.txt 输出包含叶子数、内部节点数、节点总数、最长重复序列的长度以及该序列的起始索引。 该软件已获得 MIT 许可。
【文件预览】：
SuffixTree-master
----src()
--------SuffixTree.h(2KB)
--------io.h(174B)
--------main.cpp(882B)
--------SuffixTreeNode.cpp(297B)
--------io.cpp(747B)
--------SuffixTree_test.cpp(2KB)
--------SuffixTree.cpp(8KB)
--------SuffixTreeNode.h(653B)
----inputs()
--------Slyco.fas(154KB)
--------s2.fas(16B)
--------Human-BRCA2-cds.fasta(12KB)
--------chr12.fas(1.05MB)
--------s1.fas(11B)
----doc()
--------Yeast_BWT.txt(2.06MB)
--------Human-BRCA2-cds_BWT.txt(22KB)
--------s1_BWT.txt(14B)
--------s2_BWT.txt(24B)
--------Tomato_BWT.txt(304KB)
--------Human_BWT.txt(22KB)
--------report.pdf(45KB)
--------report.tex(3KB)
----LICENSE(1KB)
----Makefile(597B)
----outputs()
--------s2.fas.BWT.txt(24B)
--------Human-BRCA2-cds.fasta.BWT.txt(22KB)
--------s1.fas.BWT.txt(14B)
----.gitignore(28B)
----readme.md(309B)
----alphabets()
--------English_alphabet.txt(52B)
--------DNA_alphabet.txt(8B)