文件名称：PLINK.jl:Julia模块处理PLINK BED文件
文件大小：46.66MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-22 05:16:42
Julia
PLINK.jl 在Julia中处理模块。 该软件包为PLINK .bed文件提供了解压缩和压缩例程。压缩的基因型矩阵x存储为一串Int8组件，其中每个8位整数最多存储四个基因型。 PLINK.jl还提供了线性代数例程，可实时解压缩x ，包括x * y和x' * y 。 未来的发展将针对。 下载 在Julia提示符下，键入 Pkg.clone("https://github.com/klkeys/PLINK.jl") 基本用途 PLINK.jl的核心是BEDFile对象： immutable BEDFile{T <: Float, V <: SharedMatrix} geno :: GenoMatrix covar :: CovariateMatrix{T, V} means :: SharedVector{T} precs :: SharedVe
【文件预览】：
PLINK.jl-master
----.travis.yml(344B)
----data()
--------test.log(2KB)
--------means.bin(128KB)
--------test.bim(30B)
--------x_test.bim(494KB)
--------test.ped(138B)
--------x_test.bed(28.61MB)
--------test_t.bed(9B)
--------covfile.txt(10KB)
--------test.fam(72B)
--------precs.bin(128KB)
--------test.map(23B)
--------x_test.fam(86KB)
--------generate_test_data.jl(821B)
--------test.bed(7B)
--------xt_test.bed(28.61MB)
----test()
--------PLINK_tests.jl(4KB)
----src()
--------linalg.jl(32KB)
--------gpu.jl(9KB)
--------bedfile.jl(10KB)
--------PLINK.jl(4KB)
--------genomatrix.jl(6KB)
--------covariate.jl(3KB)
--------kernels()
--------data.jl(5KB)
--------compression.jl(2KB)
--------decompression.jl(8KB)
----LICENSE.md(1KB)
----.gitignore(28B)
----REQUIRE(57B)
----README.md(7KB)
----utils()
--------README.txt(281B)
--------plink_data.cpp(17KB)
--------plink_data.hpp(1KB)
--------plink_data(1.25MB)
--------compile.sh(46B)