文件名称:MultiAssayExperiment:用于管理多测定数据的生物导体包装
文件大小:383KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-24 00:21:24
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多重分析实验 用于在生物导体中整合多组实验的软件 安装 我们建议在Bioconductor中安装MultiAssayExperiment的稳定发行版。 这可以使用BiocManager完成: if (!require("BiocManager")) install.packages("BiocManager") library(BiocManager) install("MultiAssayExperiment") 原理图 这是MultiAssayExperiment类的直观概述。 三个主要组成部分是: colData表型数据 ExperimentList实验结果表列表 sampleMap “样本”和“参与者”的图形表示 注意。 为了简单起见,我们使用术语“样本”和“参与者”来阐明这种关系,尽管MultiAssayExperiment可以在其他生物学样本上使用。 备忘单 即用型
【文件预览】:
MultiAssayExperiment-master
----.travis.yml(560B)
----man()
--------MultiAssayExperimentToMAF.Rd(692B)
--------MultiAssayExperiment-package.Rd(1KB)
--------ExperimentList.Rd(3KB)
--------miniACC.Rd(2KB)
--------MultiAssayExperiment.Rd(3KB)
--------subsetBy.Rd(5KB)
--------hasAssay.Rd(680B)
--------MultiAssayExperiment-methods.Rd(4KB)
--------reexports.Rd(403B)
--------MatchedAssayExperiment-class.Rd(1007B)
--------mapToList.Rd(1KB)
--------upsetSamples.Rd(2KB)
--------prepMultiAssay.Rd(3KB)
--------MultiAssayExperiment-helpers.Rd(12KB)
--------HDF5MultiAssayExperiment.Rd(3KB)
--------ExperimentList-class.Rd(4KB)
--------MultiAssayExperiment-class.Rd(8KB)
----data()
--------miniACC.RData(188KB)
----NAMESPACE(2KB)
----.github()
--------stale.yml(702B)
----NEWS.md(16KB)
----tests()
--------testthat()
--------testthat.R(117B)
----inst()
--------CITATION(1KB)
--------scripts()
----.lintr(347B)
----appveyor.yml(2KB)
----_pkgdown.yml(2KB)
----vignettes()
--------UsingHDF5Array.Rmd(3KB)
--------MultiAssayExperiment.png(14KB)
--------QuickStartMultiAssay.Rmd(14KB)
--------.install_extras(25B)
--------MultiAssayExperiment.Rmd(36KB)
--------extras()
--------MultiAssayExperiment_cheatsheet.pdf(66KB)
--------MultiAssayExperiment_cheatsheet.pdf.asis(165B)
----.Rbuildignore(603B)
----wercker.yml(410B)
----.gitignore(298B)
----R()
--------MatchedAssayExperiment-class.R(3KB)
--------subsetBy-methods.R(11KB)
--------mapToList.R(1KB)
--------MultiAssayExperiment-subset.R(3KB)
--------upsetSamples.R(2KB)
--------reexports.R(381B)
--------MultiAssayExperiment-helpers.R(30KB)
--------data.R(2KB)
--------MultiAssayExperimentToMAF.R(1KB)
--------MultiAssayExperiment-pkg.R(501B)
--------saveHDF5MultiAssayExperiment.R(6KB)
--------ExperimentList-class.R(7KB)
--------MultiAssayExperiment-methods.R(11KB)
--------listToMap.R(1KB)
--------hasAssay.R(1KB)
--------MultiAssayExperiment-class.R(27KB)
--------utilities.R(439B)
--------assay-methods.R(4KB)
--------prepMultiAssay.R(6KB)
----DESCRIPTION(2KB)
----README.md(5KB)
----.gitattributes(53B)