GSVA:R的GSVA生物导体包装的命令行界面和python模块

时间:2024-05-22 14:38:23
【文件属性】:

文件名称:GSVA:R的GSVA生物导体包装的命令行界面和python模块

文件大小:192KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-22 14:38:23

Python

GSVA / ssGSEA命令行界面和Python模块 R bioconductor的GSVA(基因组差异分析)软件包可有效地计算单样本基因组富集分析(ssGSEA)。 这个pakcage提供了一个python内置的CLI,以及带有Pandas输入和输出的Python模块,以及一个运行此R包的docker。 仓库在这里: : Autodoc手册在这里: ://jason-weirather.github.io/GSVA/ 免责声明 我不是GSVA的创建者或作者。 这是一个CLI和python钩子,旨在使它们的程序包易于从命令行和python使用。 这不是GSVA生物导体包装的官方网站 在这里找到官方的R包 如果您觉得这很有用,请引用作者的出版物 HänzelmannS,Castelo R和Guinney J(2013)。 “ GSVA:微阵列和RNA-Seq数据的基因组变异分析。”


【文件预览】:
GSVA-master
----setup.py(1KB)
----.gitignore(1KB)
----Dockerfile(1KB)
----GSVA()
--------__init__.py(16KB)
--------gsva.r(1KB)
----LICENSE(12KB)
----README.md(14KB)
----build.sh(24B)
----meta.yaml(425B)
----source()
--------index.rst(376B)
--------conf.py(5KB)
----docs()
--------py-modindex.html(3KB)
--------_static()
--------searchindex.js(3KB)
--------genindex.html(3KB)
--------objects.inv(293B)
--------index.html(10KB)
--------.doctrees()
--------search.html(3KB)
--------_sources()
--------.buildinfo(230B)

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