文件名称:SPOTlight:空间转录组学捕获位置反卷积
文件大小:190.88MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-19 17:40:47
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SPOTlight的目标是提供一种工具,该工具能够对包含捕获细胞混合物的每个捕获位置中存在的细胞类型和细胞类型比例进行反卷积,该技术最初是为10X的Visium开发的-空间分子切割技术-可以用于返回混合物的所有技术细胞。 SPOTlight基于NMFreg模型为每种细胞类型找到主题资料签名,并找到最适合我们要去卷积的斑点的组合。 安装 您可以使用以下命令从GitHub存储库安装最新的稳定版本: # install.packages("devtools") devtools :: install_github( " https://github.com/MarcElosua/SPOTlight " ) devtools :: install_git( " https://github.com/MarcElosua/SPOTlight " ) 或通过下载devel分支来开发最新版本 dev
【文件预览】:
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