topotools:VMD插件,用于处理拓扑信息

时间:2024-06-15 03:21:02
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文件名称:topotools:VMD插件,用于处理拓扑信息

文件大小:53KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-15 03:21:02

Tcl

VMD TopoTools软件包。 版本1.8 版权所有(c)2009,2010,2011,2012,2013,2014,2015,2016,2017,2018,2019,2020 by Axel 该软件包包含以下方面的贡献功能: Josh Vermaas(CHARMM可以正常使用的gromacs拓扑文件) 康斯坦丁W(非正交细胞的复制摩尔) 概述 TopoTools是的插件,提供了一系列Tcl命令来操纵,构建,读取和写入拓扑(即键,角度,二面体等)及其对应的属性(类型,顺序等)。 更新 也可以从以下网站获得更新的版本和错误修正版本: : 和: : 该页面还链接到说明如何使用包用于不同目的。 去做 改进“拓扑固定键”以更有效地添加大量键。 拓扑复制债券 拓扑猜测债券(使用bondrecalc并在选择之外恢复债券) 支持跨周期边界生成和复制键(对于分子晶体模型)。 更好的文


【文件预览】:
topotools-master
----topolammps.tcl(41KB)
----topogromacs.tcl(35KB)
----topoutils.tcl(17KB)
----topobonds.tcl(8KB)
----topotools.tcl(29KB)
----pkgIndex.tcl(574B)
----topoangles.tcl(7KB)
----doc()
--------index.html(35KB)
----topoatoms.tcl(5KB)
----LICENSE(1KB)
----topovarxyz.tcl(7KB)
----README.md(2KB)
----Makefile(511B)
----topohelpers.tcl(7KB)
----topoimpropers.tcl(9KB)
----topocrossterms.tcl(7KB)
----.gitignore(27B)
----topodihedrals.tcl(8KB)

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