dnaplotlib:用于 Python 的 DNA 绘图库

时间:2024-06-18 16:36:27
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文件名称:dnaplotlib:用于 Python 的 DNA 绘图库

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更新时间:2024-06-18 16:36:27

Python

DNAplotlib DNAplotlib 是一个库,可以对单个基因构建体和设计变体库进行高度可定制的可视化。 它可以在很多方面被认为是用于遗传图的 matplotlib。 生成基于出版物质量矢量的输出,用户可以轻松定制或替换渲染过程的所有方面。 除了能够更好地说明每个遗传部分的精确位置和长度的格式之外,DNAplotlib 还能够绘制符合 SBOL Visual 的图表。 这种替代的“基于跟踪”的可视化方法可以与核苷酸级信息(如 RNA-seq 读取深度或其他碱基分辨率测量)进行直接比较。 虽然预计访问将主要通过编程接口进行,但可以通过命令行脚本处理几种易于使用的基于文本的输入格式,以促进更广泛的使用。 DNAplotlib 是在 OSI OSL-3.0 许可下发布的跨平台开源软件。 如果您在任何出版物中使用 DNAplotlib,我们恳请您引用以下论文: 安装 DNAplotlib


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