文件名称：DNA-mapping:实现一个DNA mapping工具
文件大小：3.66MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-27 21:20:16
实现一个DNA mapping工具 ##1. 生物学背景 DNA mapping是重测序问题的必要步骤，同时也是发现变异的最简单的手段。详细内容参考的Introduction部分。 ##2. 问题描述 Given： Reference序列（由'A'、'C'、'G'、'T' 4种字符组成的字符串，以Fasta格式给出。） Reads序列(一个由很多'A'、'C'、'G'、'T' 4种字符组成的字符串集合，以Fastq格式给出。) Return： 每个Read在Reference的最佳(最小)比对位置，以HIT格式输出。 ##3. 基于Hash表的比对算法 ##4. 数据格式 ###Fasta格式 标准genome和read存储格式。更多内容参考。 实例: 说明 实例 序列名称 >Reference1 序列 AATTAGGACACACAAGAGCACACAGGAacaTAGcag 序列名称 >
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DNA-mapping-master
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