文件名称：杨树锈菌表达序列微卫星分析及EST-SSR标记开发1) (2012年)
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更新时间：2024-06-12 15:44:39
自然科学 论文
通过对64498条杨树锈菌EST进行拼接，得到1 998个拼接片段(contigs)，发现了604个SSR位点。在拼接片段中SSR平均密度为每736．6 bp含有1个SSR。在SSR中，三核苷酸重复基元的SSR类型最多，占总数的44．70％。在二碱基重复中，最主要的优势重复单元是AC和AT，三碱基中AGT和AAG为优势重复单元，四碱基、五碱基重复类型中，(AAAN)n和(AAAAN)n为对应的优势重复单元，这些优势重复单元中富含碱基A和T，研究还发现杨树锈菌表达序列中微卫星丰度很高。杨树锈菌突变频率很高，