MagicLamp:使用HMM集有针对性地注释(元)基因组和(元)转录组数据集的平台

时间:2021-04-28 18:44:35
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文件名称:MagicLamp:使用HMM集有针对性地注释(元)基因组和(元)转录组数据集的平台
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更新时间:2021-04-28 18:44:35
annotation genomics iron hmmer respiration 魔灯 使用离散HMM集注释基因组数据集的软件包。 引用MagicLamp 没有MagicLamp的官方出版物。 如果对您的工作有用,请引用以下内容: Garber,AI(2020)MagicLamp:使用精选的HMM集注释'组学数据集的工具包。 2020年:MagicLamp,GitHub存储库: : 。 安装 快速安装(如果已安装Conda) git clone bash setup.sh source activate magiccave 必需的依存关系 Python(3.6版或更高版本) BLAST(版本2.7.1+) 浪子(版本2.6.3) HMMER(3.2.1版) 可选依赖项 Diamond(0.9.22.123版)-如果您对参考数据库执行交叉验证 R(版本3.5.1)-如果生成图 Rscript-如果生成图 如果没有Conda,则进行安装 将MagicLam

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