文件名称:SWS2
文件大小:48.89MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-07 08:31:55
Python
SWS2
【文件预览】:
SWS2-master
----genome_wide_LWS_search_pos_control()
--------infiles()
--------run_blast.nanorana.py(446B)
--------make_fasta_from_tblastn7.py(3KB)
--------output()
--------run_blast.LWS.protein.py(417B)
--------remove_hyphen.py(255B)
--------make_blast_db.py(556B)
--------run_LWS_search.sh(2KB)
--------nanoranaDB()
--------translate_fasta.py(1KB)
--------get_putative_ortholog_names.py(962B)
----genome_wide_SWS2_search()
--------infiles()
--------run_blast.nanorana.py(447B)
--------make_fasta_from_tblastn7.py(3KB)
--------output()
--------make_blast_db.py(556B)
--------nanoranaDB()
--------run_SWS2_search.sh(2KB)
--------run_blast.SWS2.protein.py(419B)
--------translate_fasta.py(1KB)
--------get_putative_ortholog_names.py(960B)
----synteny()
--------infiles()
--------run_blast.py(538B)
--------remove_hyphens.py(252B)
--------output()
--------run_analyses.sh(2KB)
--------get_LWS_scaffolds.py(596B)
--------make_blast_db.py(554B)
----.gitignore(131B)