【文件属性】:
文件名称:Trinity_CTAT
文件大小:5KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-02 08:38:50
三位一体癌症转录组分析工具包(CTAT)
三位一体癌症转录组分析工具包(CTAT)旨在提供利用RNA-Seq的工具,以深入了解癌症转录组的生物学特性。 提供了生物信息学工具支持,用于突变检测,融合转录本鉴定,癌症特异性转录本的从头转录本组装,lincRNA分类和外来转录本检测(病毒,微生物)。 CTAT由美国国家癌症研究所癌症研究信息技术(NCI ITCR)计划资助。
有关Trinity CTAT中模块的描述,请访问我们的 。
每个Trinity CTAT模块在上面都组织为一个子模块,您可以单击该子模块轻松访问相关的代码和文档。
【文件预览】:
Trinity_CTAT-master
----Fusion-Transcript-Prediction()
--------TrinityFusion()
--------FusionInspector()
--------STAR-Fusion()
----Virus-Integration-Sites()
--------CTAT-VirusIntegrationFinder()
----Tumor-Copy-Number-Aberrations()
--------infercnv()
----Wiki()
--------Trinity_CTAT.wiki()
----.gitmodules(3KB)
----README.md(842B)
----Cancer-Splicing-Aberrations()
--------CTAT-SPLICING()
----RNAseq-Assembly()
--------DISCASM()
--------trinityrnaseq()
----Mutations-via-RNAseq()
--------ctat-mutations()