文件名称：Trinity_CTAT
文件大小：5KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-22 02:25:30
三位一体癌症转录组分析工具包（CTAT） 三位一体癌症转录组分析工具包（CTAT）旨在提供利用RNA-Seq的工具，以深入了解癌症转录组的生物学特性。 提供了生物信息学工具支持，用于突变检测，融合转录本鉴定，癌症特异性转录本的从头转录本组装，lincRNA分类和外来转录本检测（病毒，微生物）。 CTAT由美国国家癌症研究所癌症研究信息技术（NCI ITCR）计划资助。 有关Trinity CTAT中模块的描述，请访问我们的 。 每个Trinity CTAT模块在上面都组织为一个子模块，您可以单击该子模块轻松访问相关的代码和文档。
【文件预览】：
Trinity_CTAT-master
----Fusion-Transcript-Prediction()
--------TrinityFusion()
--------FusionInspector()
--------STAR-Fusion()
----Virus-Integration-Sites()
--------CTAT-VirusIntegrationFinder()
----Tumor-Copy-Number-Aberrations()
--------infercnv()
----Wiki()
--------Trinity_CTAT.wiki()
----.gitmodules(3KB)
----README.md(842B)
----Cancer-Splicing-Aberrations()
--------CTAT-SPLICING()
----RNAseq-Assembly()
--------DISCASM()
--------trinityrnaseq()
----Mutations-via-RNAseq()
--------ctat-mutations()