TMH_insertion_energy:推断 TMH 插入能量

时间:2024-08-24 09:25:05
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文件名称:TMH_insertion_energy:推断 TMH 插入能量

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更新时间:2024-08-24 09:25:05

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TMH_insertion_energy 从具有已知螺旋位置的参考序列推断 TMH 插入能量 数据 文件夹/文件 描述 reference_sequences 参考序列和相应的 HHM-profiles sequences fasta 格式的序列 profiles 使用 hhblits 针对 UniRef30 数据库创建的 HHM 配置文件 hhalign_X 每个轮廓与参考轮廓 X 的 HMM-HMM 对齐 dgpred_results 推断的螺旋和相应的 dgpred 能量计算 sequences.fasta 一个 fasta 文件中的所有序列 TMH_insertion_energies.xlsx 19 个残基窗口和全长螺旋的能量值和序列 脚本 python3 脚本fasta_to_helices.py将 fasta 格式的序列列表、相应的 HMM-profiles


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