【文件属性】：
文件名称：TMH_insertion_energy:推断 TMH 插入能量
文件大小：211.11MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-08-04 15:38:25
HTML
TMH_insertion_energy
从具有已知螺旋位置的参考序列推断 TMH 插入能量
数据
文件夹/文件
描述
reference_sequences
参考序列和相应的 HHM-profiles
sequences
fasta 格式的序列
profiles
使用 hhblits 针对 UniRef30 数据库创建的 HHM 配置文件
hhalign_X
每个轮廓与参考轮廓 X 的 HMM-HMM 对齐
dgpred_results
推断的螺旋和相应的 dgpred 能量计算
sequences.fasta
一个 fasta 文件中的所有序列
TMH_insertion_energies.xlsx
19 个残基窗口和全长螺旋的能量值和序列
脚本
python3 脚本fasta_to_helices.py将 fasta 格式的序列列表、相应的 HMM-profiles