miloR:Milo的R包实现用于在KNN图中测试差分丰度

时间:2024-04-26 10:16:14
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文件名称:miloR:Milo的R包实现用于在KNN图中测试差分丰度

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更新时间:2024-04-26 10:16:14

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lo Milo是一种用于从单细胞数据集中对KNN图进行差分丰度分析的方法。 有关更多详细信息,请阅读。 安装 ## Install development version devtools::install_github("MarioniLab/miloR") 讲解 :包括用于下游分析功能的演示。 工作流程示例 开始的Milo工作流程示例: data(sim_trajectory) milo.meta <- sim_trajectory$meta milo.obj <- Milo(sim_trajectory$SCE) milo.obj 建立图表和社区。 milo.obj <- buildGraph(milo.obj, k=20, d=30) milo.obj <- makeNhoods(milo.obj, k=20, d=30, refined=TRUE, prop=0.2) 计算


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