【文件属性】:
文件名称:miloR:Milo的R包实现用于在KNN图中测试差分丰度
文件大小:5.8MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-04-06 16:29:34
R
lo
Milo是一种用于从单细胞数据集中对KNN图进行差分丰度分析的方法。 有关更多详细信息,请阅读。
安装
## Install development version
devtools::install_github("MarioniLab/miloR")
讲解
:包括用于下游分析功能的演示。
工作流程示例
开始的Milo工作流程示例:
data(sim_trajectory)
milo.meta <- sim_trajectory$meta
milo.obj <- Milo(sim_trajectory$SCE)
milo.obj
建立图表和社区。
milo.obj <- buildGraph(milo.obj, k=20, d=30)
milo.obj <- makeNhoods(milo.obj, k=20, d=30, refined=TRUE, prop=0.2)
计算