文件名称：fishtree:鱼生命树的R接口
文件大小：34KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-03 01:03:57
cran r phylogeny R
鱼树 fishtree的目标是在R中提供与Life Tree of Life API的简单接口，以下载分类法，系统发育，多样化率信息以及其他有关有鳍鱼类的数据。 它应与R生态系统的其余部分（尤其是封装ape无缝集成。 例子 查看可下载的分类单元列表。 library( fishtree ) tax <- fishtree_taxonomy() head( tax ) # > rank name # > 1 class Actinopteri # > 2 class Cladistia # > 3 subclass Chondrostei # > 4 subclass Neopterygii # > 5 infraclass Holostei # > 6 infraclass Teleostei 检索刺尾鱼的系统发育
【文件预览】：
fishtree-master
----.github()
--------dependabot.yml(117B)
--------ISSUE_TEMPLATE()
--------workflows()
----vignettes()
--------community-analysis.Rmd(4KB)
--------comparative-analysis.Rmd(9KB)
--------.gitignore(20B)
----fishtree.Rproj(396B)
----NAMESPACE(213B)
----NEWS.md(2KB)
----cran-comments.md(631B)
----DESCRIPTION(1KB)
----inst()
--------WORDLIST(444B)
--------CITATION(1KB)
----R()
--------functions.R(17KB)
--------fishtree-package.R(782B)
--------zzz.R(63B)
--------utils.R(4KB)
----.Rbuildignore(348B)
----LICENSE(44B)
----README.md(3KB)
----Makefile(60B)
----man()
--------fishtree_rogues.Rd(1KB)
--------fishtree_tip_rates.Rd(3KB)
--------fishtree_phylogeny.Rd(3KB)
--------fishtree_alignment.Rd(1KB)
--------fishtree_complete_phylogeny.Rd(3KB)
--------fishtree_taxonomy.Rd(1KB)
--------fishtree-package.Rd(1KB)
----tests()
--------spelling.R(161B)
--------testthat()
--------testthat.R(60B)
----.gitignore(75B)
----README.Rmd(3KB)