BINDKIN:衡量点突变对激酶-配体相互作用影响的结构基准

时间:2021-05-27 22:41:28
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文件名称:BINDKIN:衡量点突变对激酶-配体相互作用影响的结构基准
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更新时间:2021-05-27 22:41:28
HTML 数据库功能 一种结构基准,用于测量点突变对蛋白激酶-配体相互作用的影响。 为了构建BINDKIN(点突变对蛋白KINase:配体复合物的BINDing亲和力的影响)基准,我们在Protein Data Bank(PDB)中进行了彻底搜索(Berman等,2000)(rcsb.org)。可用的野生型和突变型激酶:配体复合物的列表。 结果列表是根据以下标准进行整理的: 对于每个突变体复合物,必须有一个包含相同蛋白质和配体的野生型复合物。 野生型和突变体复合物应在同一研究中确定(即它们应来自同一研究论文)。 对于每种复合物,必须有实验确定的结合亲和力,形式为IC50,Kd或Ki。 配体必须是可逆的(非共价)配体。 实验性结合动力学数据来自PDBbind(Cheng等,2009; Wang等,2004,2005)(pdbbind-cn.org/index.asp)、Binding DB

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