genome-tools-开源

时间:2024-05-18 00:17:33
【文件属性】:

文件名称:genome-tools-开源

文件大小:45KB

文件格式:GZ

更新时间:2024-05-18 00:17:33

开源软件

Genome-tools提供了灵活的工具和简单的API,可对以标准Genbank格式发布的基因组进行基因组序列处理。 还提供基于CGI的Web界面。 请引用:Lee W.,Chen SL BioTechniques 33:1334-1341(Dec 20


【文件预览】:
genome-tools-1.23
----etc()
--------genome-tools.conf.debian(164B)
----bin()
--------circular-graph.pl(4KB)
--------subseq.pl(3KB)
--------MW.pl(3KB)
--------convert_gid_synonym.pl(2KB)
--------gene-graph.pl(8KB)
--------nearestorf.pl(11KB)
--------print-genome-file.pl(1KB)
--------chompnewline.pl(1KB)
--------translate.pl(6KB)
--------intergenic.pl(4KB)
--------codonuse.pl(4KB)
--------gatc.pl(3KB)
--------revcomp.pl(2KB)
--------get_fasta.pl(2KB)
--------position.pl(4KB)
--------ptt-to-ffn.pl(1KB)
--------ffn-to-ptt.pl(3KB)
--------surround.pl(2KB)
--------orfregion.pl(7KB)
--------ptt-to-faa.pl(1KB)
--------chromosome-spacing.pl(3KB)
----COPYING(18KB)
----sbin()
--------rnatab-to-ptt.pl(4KB)
--------mergeptt.pl(2KB)
--------update-genome.pl(14KB)
--------preproc-all-genomes.pl(2KB)
--------orfquality.pl(6KB)
--------preproc-new-genome.pl(6KB)
--------trna-stats.pl(2KB)
----setup.pl(7KB)
----INSTALL(3KB)
----lib()
--------org-map.sample(14KB)
--------Orgmap.pm(6KB)
----upgrade-genome-tools.pl(5KB)

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