文件名称：janggu:生物信息学的深度学习基础架构
文件大小：3.42MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-16 15:38:55
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Janggu-基因组学的深度学习 Janggu是一个Python软件包，可促进在基因组学方面的深度学习。 该软件包可根据GPL-3.0许可免费获得。 特别是，该软件包可轻松访问典型的Genomics数据格式和开箱即用的评估（特别是针对keras模型），因此您可以集中精力设计神经网络体系结构，以快速测试生物学假设。 提供全面的文档。 长谷的标志： Janggu提供了特殊的Genomics数据集，使您可以访问FASTA，BAM，BIGWIG，BED和GFF文件格式的原始数据。 支持各种规范化程序来处理基因组数据集，包括“ TPM”，“ zscore”或自定义规范化器。 可以用更高阶的序列特征来表示生物学特征，例如基于二核苷酸的特征。 数据集对象可直接与神经网络一起使用，例如使用或（请参见此存储库中的src / examples）。 keras模型的Numpy格式输出可以转换为代表