文件名称：graphein:蛋白质图库
文件大小：10.94MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-02 12:49:09
bioinformatics deep-learning structural-biology protein-data-bank protein-structure
| 蛋白质图库 该软件包提供了用于产生多种类型的基于图的蛋白质表示的功能。 我们提供与标准格式以及为易于与流行的深度学习库一起使用而设计的图形对象的兼容性。 什么是新的？ 蛋白质图可视化！ 从Dotbracket表示法构建RNA图 用法示例 创建蛋白质图 from graphein . construct_graphs import ProteinGraph # Initialise ProteinGraph class pg = ProteinGraph ( granularity = 'CA' , insertions = False , keep_hets = True , node_featuriser = 'meiler' , get_contacts_path = '/Users/arianjamasb/github/getcont
【文件预览】：
graphein-master
----README.md(9KB)
----ubuntu_environment.yml(4KB)
----environment.yml(5KB)
----docs()
--------make.bat(799B)
--------source()
--------Makefile(638B)
----examples()
--------meshes()
--------ppi()
--------contacts()
--------pdbs()
----LICENSE(1KB)
----datasets()
--------README.md(2KB)
--------pscdb()
--------ppisp()
----.rtd.requirements.txt(479B)
----citation.bib(368B)
----imgs()
--------graphein.png(1.12MB)
--------graph_construction_overview.png(133KB)
----requirements.txt(187B)
----setup.py(2KB)
----graphein()
--------visualisation.py(5KB)
--------construct_graphs.py(70KB)
--------utils.py(325B)
--------__init__.py(198B)
--------construct_meshes.py(3KB)
----.readthedocs.yml(657B)