文件名称：gseaCondenser:压缩GSEA条款
文件大小：176KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-08 20:52:32
R
gseaCondenser 软件包旨在更好地概述GSEA。 目录： 安装 从git仓库安装软件包： devtools :: install_github( " nicolash2/ggbrace " ) 浓缩GSEA condenseGsea采用data.frame，该数据框必须具有一个带有基因的列。 这些可能是找到的所有基因，也可能是集合中的所有基因，也可能只是前沿。 condenseGsea将返回相同的data.frame，但具有3个附加列，这是所有列condenseDropout中最重要的一个，它指示此集合是否冗余。 如果术语与另一组共享足够的基因，则它们是多余的。 较小的集合（就其具有的基因数量而言）将总是被较大的集合吃掉并变得多余。 condenseChildren列中列出了一个集合消耗了哪些集合。 其中的数字指的是给定集合的condenseID（任意编号）。 libr
【文件预览】：
gseaCondenser-main
----man()
--------freqGsea.Rd(2KB)
--------hello.Rd(128B)
--------condense_gsea.Rd(1KB)
----data()
--------mySetlist.RData(17KB)
--------myRankedlist.RData(136KB)
--------myGsea.RData(3KB)
----NAMESPACE(85B)
----.Rhistory(23KB)
----.Rproj.user()
--------shared()
--------78020A5A()
----.Rbuildignore(28B)
----R()
--------condenseGsea.R(2KB)
--------freqGsea.R(3KB)
----DESCRIPTION(394B)
----README.md(2KB)
----gseaCondenser.Rproj(356B)