文件名称：mpcircle:从WGS MP序列数据绘制CIRCOS图
文件大小：14KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-07 16:07:18
Shell
mpcircle 杂技表演从MP排序数据。 丹尼尔·尼尔森（Daniel Nilsson），2015年 根据perl艺术许可提供。 用法 plot_all.sh [prefix] [template_circos_config] 默认设置是尝试绘制各个行驶数据目录（CNVnator输出，变量选项卡和ROI文件）中的所有文件的图。 有关预期数据及其格式的更多详细信息，请参见数据子目录。 安装 需要UCSC的kgXref和knownGene表的副本。 下载例如： curl -O http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/database/kgXref.txt.gz 到refs子目录或相应地在KGXREF和KNOWNGENE中设置路径。 或从refs子目录链接。
【文件预览】：
mpcircle-master
----.gitignore(3B)
----data()
--------FT_links()
--------CNVnator()
--------highlight()
--------ROI()
--------variations()
----etc()
--------MP_template_w_genes_zoom.conf(4KB)
--------MP_template_w_genes_zoom_shrinkable.conf(4KB)
--------README(117B)
----bin()
--------plot_all.sh(3KB)
--------make_highlight_genes.sh(2KB)
----LICENSE(9KB)
----README.md(6B)
----plots()
--------README(26B)
----refs()
--------README(305B)
----README(719B)