文件名称：Pseudomonas-aeruginosa-ICU-patients
文件大小：1.43MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-03 11:36:50
Python
标题 概括 依存关系 的Python 3.7 Perl RAxML R版本3.5.1 wa samtools 黑桃 回购内容 元数据：用于分析的样本数据和预处理数据。 PA ref基因组： PA ref gff文件： dir：其他细菌的基因组 结果： 脚本： SNP呼叫 映射到参考基因组： SNP呼叫 iSNV_calling.sh 3 iSNV_calling.sh 4 重复区域 将ref基因组切割为150bp的模拟序列： python切 将模拟读数映射到其他细菌基因组 系统发育分析 准备SNP序列： python XXX 系统发育分析原为 raxmlHPC-PTHREADS -s $align_trim_file -n raxmltree_result -m GTRGAMMAI -fa -x 12345 -N 1000 -p 123456 -T 24 -k