文件名称：EvolutionaryAction.jl:在 Julia 中实现进化动作
文件大小：9KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-09 12:08:11
Julia
进化动作 概括 这是发布的 Evolutionary Action (EA) 方法的实现。 使用系统发育学和比较基因组学的方法，通过量化突变对适应度的影响来评估基因型和表型之间的关系。 EA 被证明与实验量化的突变影响有很好的相关性。 要求 您需要在系统上安装和并将可执行文件分别命名为fasttree和raxml 。 FastTree 用于无根树的重建，RAxML 用于树的生根。 此外，还需要以下 Julia 包： 细节 作为输入，您“仅”需要蛋白质序列的多重比对或一组此类比对。 使用-p选项启动 Julia 以利用其内部并行化。 FastTree 可以使用多个线程。 地位 测试版 在 Linux 上开发和测试（但不是大量） 安装 该软件包尚未注册为官方 Julia 软件包。 您可以通过在 Julia REPL 中运行Pkg.clone("https://github.com/chra
【文件预览】：
EvolutionaryAction.jl-master
----src()
--------typedefs.jl(836B)
--------lowlevel.jl(5KB)
--------highlevel.jl(13KB)
--------EvolutionaryAction.jl(576B)
----.travis.yml(510B)
----test()
--------runtests.jl(83B)
----LICENSE.md(1KB)
----README.md(1KB)