pubchem-utils:与 PubChem 交互的实用程序

时间:2024-07-15 09:07:29
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文件名称:pubchem-utils:与 PubChem 交互的实用程序

文件大小:17KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-15 09:07:29

Python

pubchem-utils 与交互的实用程序 注意:有时一个或多个测试失败,但在重新运行时通过。 在我可以编写更好的测试来捕捉这种行为之前,我已经删除了 Travis 指标,以免给人留下错误的印象。 使用此代码时请仔细检查您的结果,以防偶发故障。 快速开始 from pubchem_utils import PubChem pc = PubChem () 下载一批 CID 的 3D 结构: pc . get_records ([ 2244 , 3672 ], filename = 'painkillers.sdf.gz' , use_3d = True ) 检索 PubChem BioAssay 实验中活跃的 SID: sids = pc . get_ids_from_assay ( 466 , sids = True , activity_outcome = 'activ


【文件预览】:
pubchem-utils-master
----.travis.yml(294B)
----pubchem_utils()
--------test()
--------__init__.py(20KB)
--------pug.py(6KB)
--------scripts()
----LICENSE(1KB)
----requirements.txt(13B)
----setup.py(352B)
----.gitignore(544B)
----README.md(1KB)

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