文件名称:panoptes:实时监控计算工作流程
文件大小:1.34MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-13 12:03:00
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生物信息学家和数据科学家依靠计算框架(例如 , , , )来处理,分析和集成各种类型的数据。 这样的框架允许科学家以统一的方式组合不同来源的软件和自定义工具,从而使他们可以重现其他人的结果,或者在不同的数据集上重复使用相同的管道。 基本问题之一是,大多数用户同时执行多个管道,或对大量数据集执行多步骤管道,或同时执行这两个步骤,因此很难跟踪各个步骤的执行或监视哪个步骤。处理过的数据集是完整的。 panoptes是监视此类工作流程执行情况的工具。 panoptes是可以由以下人员使用的服务: 数据科学家,生物信息学家等,希望对其管道的进度和工作状态有一个总体的了解 想要监视其服务器的主管 想要将服务集成到更大的Web应用程序中的Web开发人员 注意: panoptes处于开发的早期阶段,第一个概念验证服务器将仅支持使用编写的工作流。 安装 基本安装过程 要求 Python> = 3.
【文件预览】:
panoptes-master
----setup.py(1KB)
----.gitignore(244B)
----Dockerfile(785B)
----requirements.txt(101B)
----contributors.md(337B)
----LICENSE.md(1KB)
----.travis.yml(2KB)
----MANIFEST.in(48B)
----CONTRIBUTING.md(2KB)
----CODE_OF_CONDUCT.md(3KB)
----panoptes()
--------__init__.py(27B)
--------database.py(739B)
--------static()
--------models.py(5KB)
--------tests()
--------schema_forms.py(672B)
--------app.py(5KB)
--------panoptes.py(1KB)
--------routes()
--------server_utilities()
----.github()
--------ISSUE_TEMPLATE()
----docker-compose.yaml(173B)
----README.md(5KB)
----meta.yaml(1KB)