文件名称:TENETR.data:TENET R包的R数据包
文件大小:125.29MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-18 06:12:08
R
TENETR.data包 包含TENET R包的数据对象(正在建设中) 上次更新时间:2020年10月26日 引文 Mullen DJ等。 TENET 2.0:确定肺腺癌中关键的转录调节子和增强子。 Plos Genetics 2020 16(9):e1009023。 Rhie SK等。 通过使用表观遗传特征追踪增强子网络,鉴定乳腺癌,前列腺癌和肾脏肿瘤中激活的增强子和相关的转录因子。 表观遗传染色质2016年11月9日; 9:50。 PMID:27833659 1. TENETR.data安装 最好使用devtools R软件包( )进行安装 if (!require("devtools", quietly = TRUE)){ install.packages('devtools') } devtools::install_github('DanielJMullen/TENET
【文件预览】:
TENETR.data-master
----man()
--------hm27_hg38_annotations.Rd(7KB)
--------consensus_enhancer_regions.Rd(920B)
--------consensus_open_chromatin_regions.Rd(888B)
--------epic_hg38_annotations.Rd(7KB)
--------hg38_chrom_sizes.Rd(610B)
--------hm450_hg38_annotations.Rd(7KB)
--------human_transcription_factors_dataset.Rd(6KB)
--------gencode_v22_annotations.Rd(4KB)
----data()
--------gencode_v22_annotations.rda(22.06MB)
--------hm27_hg38_annotations.rda(1.98MB)
--------hg38_chrom_sizes.rda(3KB)
--------human_transcription_factors_dataset.rda(237KB)
--------epic_hg38_annotations.rda(48.9MB)
--------hm450_hg38_annotations.rda(28.92MB)
--------consensus_open_chromatin_regions.rda(20.69MB)
--------consensus_enhancer_regions.rda(2.84MB)
----data-raw()
--------HM27_hg38_annotations.R(2KB)
--------hm450_hg38_annotations.R(2KB)
--------consensus_enhancer_regions.R(9KB)
--------EPIC_hg38_annotations.R(2KB)
--------hg38_chrom_sizes.R(1KB)
--------human_transcription_factors_dataset.R(975B)
--------gencode_v22_annotations.R(1KB)
--------consensus_open_chromatin_regions.R(3KB)
--------Initiatizing_package.R(851B)
----NAMESPACE(46B)
----.Rbuildignore(49B)
----.gitignore(38B)
----R()
--------data.R(31KB)
----TENETR.data.Rproj(386B)
----DESCRIPTION(1005B)
----README.md(928B)