文件名称：角点检测代码matlab-mito_track:mito_track
文件大小：41.96MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-15 13:31:23
系统开源
角点检测代码matlab 线粒体追踪 该存储库包含用于分析秀丽隐杆线虫单细胞胚胎中线粒体流动的代码。 有四个脚本： mito_track.py ：使用OpenCV库进行拐角检测和流量估计。 它输出带有所有跟踪点坐标的几个.csv文件。 coord_process.R ：估计膜的位置，方向以及到跟踪点的膜的距离。 plot.R ：产生与图S1A和S3E-H中相同的图所必需的代码。 Mito_to_membrane_distance.m ：计算图2G和S2F中使用的线粒体和膜之间超过360度的距离。 依存关系 Python = 3.7.2 open-cv = 4.1.2.30 numpy = 1.17.4 tiffcapture = 0.1.6 R = 3.6.1 ijtiff = 2.0.4 ggplot2 = 3.2.1 RColorBrewer = 1.1 tiff = 0.1 Matlab = Mathworks version R2014a 执照