pviz-app-vep

时间:2024-07-07 01:28:30
【文件属性】:

文件名称:pviz-app-vep

文件大小:589KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-07 01:28:30

JavaScript

#pViz.js/VEP 查看器:浏览器端唯一的应用程序,用于查看集成变体效果预测器输出文件集成变生成“.vep”文件,其中包含变体的蛋白质定位特征。 我们提出了一个工具来解析这样的输出,从检索蛋白质序列,并对齐序列上的特征,按类别分组。 ##数据源 任何“.vep”文件都可以安装在工具中,无论是测试集还是加载的本地文件。 可以在大约 10 秒内在 chrome 浏览器中解析多达 1.5M 行的文件。 ###Parsed features 显示具有蛋白质位置的任何特征。 默认情况下,在服务器上检索序列时,默认情况下只能显示带有“ENSP.+”标识符的蛋白质(更改配置菜单中的 Ensembl REST url 以连接到本地存储)。 将鼠标悬停在要素上时,会显示“附加”列中的字段。 该应用程序可以在实时使用 ##Usage 输入基因名称以显示相关蛋白质。 拖动鼠标放大序列,双击缩小。


【文件预览】:
pviz-app-vep-master
----package.json(1KB)
----test()
--------.bowerrc(40B)
--------index.html(726B)
--------spec()
--------bower.json(143B)
----.bowerrc(44B)
----app()
--------.htaccess(20KB)
--------404.html(4KB)
--------data()
--------robots.txt(31B)
--------index.html(8KB)
--------lib()
--------styles()
--------scripts()
--------favicon.ico(1KB)
----Gruntfile.js(10KB)
----TODO.txt(2KB)
----README.md(3KB)
----.jshintrc(642B)
----bower.json(393B)
----.editorconfig(373B)
----LICENSE.txt(2KB)

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