SimulaTE-开源

时间:2024-06-19 23:36:48
【文件属性】:

文件名称:SimulaTE-开源

文件大小:268KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-19 23:36:48

开源软件

SimulaTE 允许模拟转座元素 (TE) 的任意复杂景观。 此外,可以使用群体中所有个体的基因组作为模板来模拟读数。 可以使用不同的测序技术(PacBio,Illumina配对末端)和策略(对个体和群体进行测序)来模拟读取。 SimulaTE 将极大地帮助评估估计种群内 TE 丰度的不同方法的适用性,并测试给定的基因组资源,例如参考基因组或 TE 数据库(包含 TE 共有序列的 fasta 文件)是否适用于 TE 识别. 手动 https://sourceforge.net/p/simulates/wiki/Home/#manual 演练 https://sourceforge.net/p/simulates/wiki/Home/#walkthrough 验证 https://sourceforge.net/p/simulates /wiki/主页/#validation


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