文件名称：shiny-MDM:适用于 MDM 数据集的闪亮应用
文件大小：7.72MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-28 20:02:53
R
GOexpress（MDM 满） 包裹在 Bioconductor 包的输出对象周围的闪亮应用程序示例。 GOexpress：表达数据的基因本体 GOexpress 是一个软件包，设计用于基因表达谱的可视化，以及与基因最佳聚类实验样本组相关的稳健分子功能（基因本体）的识别。 可视化 基因表达谱可以针对单个样品系列进行可视化，按样品组进行汇总，或按基因本体进行汇总。 我们将这三种类型的图分别称为“expression_profiles”、“expression_plot”和“heatmap_GO”。 评分和排名 有趣的基因和基因本体的识别是使用称为随机森林的监督聚类方法进行的，随后通过对与公共本体相关的所有基因的结果进行平均，在基因本体级别进行总结。 数据 在这里，我们使用一项研究的结果创建了一个小应用程序，在该应用程序中，我们寻找最佳聚类牛单核细胞衍生巨噬细胞的基因和基因本体，这些巨噬细
【文件预览】：
shiny-MDM-master
----.gitignore(178B)
----data()
--------GOx.Infection.pval.rds(1.21MB)
--------external_gene_names.rds(29KB)
--------MDM.eSet.rds(5.57MB)
--------GOx.Infection.rds(1.2MB)
--------go_choices.rds(171KB)
----LICENSE(34KB)
----server.R(5KB)
----README.md(1KB)
----DESCRIPTION(205B)
----ui.R(10KB)