【文件属性】：
文件名称：map_align:接触图对齐
文件大小：1.49MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-24 04:55:47
C++
map_align
map_align获取两个联系人贴图，并返回一个路线，该路线尝试最大化重叠触点的数量，同时最小化间隙的数量。
更新
（2018年2月20日）一个直接与PDB结构一起使用的新实现： :
安装
$ g++ -O3 -std=c++0x -o map_align main.cpp
对于并行版本：
$ g++ -O3 -std=c++0x -o map_align_omp main_omp.cpp -fopenmp
用法
-------------------------------------------------------------------
MAP_ALIGN
-------------------------------------------------------------------
-a contact map A
【文件预览】：
map_align-master
----main_omp.cpp(23KB)
----map_align_fig.png(108KB)
----README.md(4KB)
----2pd0_A.pdb.map(38KB)
----mk_map()
--------5CAJ_A.ss(27KB)
--------5CAJ_A.map(64KB)
--------5CAJ_A.chk(44KB)
--------mk_map.pl(5KB)
--------T0806.mtx(1.62MB)
--------pdb2map.pl(10KB)
--------5CAJ_A.fasta(311B)
--------T0806.chk(41KB)
--------T0806.map(55KB)
--------cmd_pdb2map(317B)
--------readme.md(2KB)
--------a3m2alncut.pl(3KB)
--------T0806.fas(759KB)
--------5CAJ_A.a3m(159KB)
--------5CAJ_A.map.pdb(80KB)
--------5CAJ_A.pdb(162KB)
--------T0806.cut(518B)
--------cmd(190B)
--------T0806.aln(511KB)
----main.cpp(23KB)
----3u97_A.gremlin.map(13KB)