文件名称:map_align:接触图对齐
文件大小:1.49MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-12 22:42:27
C++
map_align map_align获取两个联系人贴图,并返回一个路线,该路线尝试最大化重叠触点的数量,同时最小化间隙的数量。 更新 (2018年2月20日)一个直接与PDB结构一起使用的新实现: : 安装 $ g++ -O3 -std=c++0x -o map_align main.cpp 对于并行版本: $ g++ -O3 -std=c++0x -o map_align_omp main_omp.cpp -fopenmp 用法 ------------------------------------------------------------------- MAP_ALIGN ------------------------------------------------------------------- -a contact map A
【文件预览】:
map_align-master
----main_omp.cpp(23KB)
----map_align_fig.png(108KB)
----README.md(4KB)
----2pd0_A.pdb.map(38KB)
----mk_map()
--------5CAJ_A.ss(27KB)
--------5CAJ_A.map(64KB)
--------5CAJ_A.chk(44KB)
--------mk_map.pl(5KB)
--------T0806.mtx(1.62MB)
--------pdb2map.pl(10KB)
--------5CAJ_A.fasta(311B)
--------T0806.chk(41KB)
--------T0806.map(55KB)
--------cmd_pdb2map(317B)
--------readme.md(2KB)
--------a3m2alncut.pl(3KB)
--------T0806.fas(759KB)
--------5CAJ_A.a3m(159KB)
--------5CAJ_A.map.pdb(80KB)
--------5CAJ_A.pdb(162KB)
--------T0806.cut(518B)
--------cmd(190B)
--------T0806.aln(511KB)
----main.cpp(23KB)
----3u97_A.gremlin.map(13KB)