文件名称：biobambam:bam 文件处理工具
文件大小：399KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-01 04:53:58
C++
生物班 请注意 biobambam 的开发已在此存储库上停止。 请参阅biobambam2 了解最新进展。 该软件包包含一些用于处理 BAM 文件的工具，包括 bamcollate2：读取 BAM 并写入重新排序的 BAM，以便按查询名称对齐或整理 bammarkduplicates：读取 BAM 并使用 BAM 标志字段标记的重复对齐写入 BAM bammaskflags：读取 BAM 并写入 BAM，同时从标志列中屏蔽（删除）位 bamrecompress：读取 BAM 并使用定义的压缩设置写入 BAM。 该工具能够进行多线程处理。 bamsort：读取 BAM 并写入按坐标或查询名称排序的 BAM bamtofastq：读取BAM，写入FastQ； 输出可以按查询名称整理或取消整理 通过使用 -h 参数调用每个程序，可以使用一个简短的选项列表，例如 bamsort -h