rust-htslib-该库提供HTSlib绑定和用于读取和写入BAM文件的高级Rust API-Rust开发

时间:2024-06-16 12:44:06
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文件名称:rust-htslib-该库提供HTSlib绑定和用于读取和写入BAM文件的高级Rust API-Rust开发

文件大小:276KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-16 12:44:06

Rust Science

用于Rust的HTSlib绑定该库提供HTSlib绑定和用于读取和写入BAM文件的高级Rust API。 要克隆此存储库,请使用Rust的HTSlib绑定。该库提供了HTSlib绑定和用于读写BAM文件的高级Rust API。 要克隆此存储库,请发出$ git clone --recursive https://github.com/rust-bio/rust-htslib.git,以确保也提取了HTSlib子模块。 如果只想使用该库,则无需克隆存储库。 在这种情况下,请转到“用法”部分。 要求rust-htslib带有针对Mac和Linux的htslib的预构建绑定。 您将需要一个


【文件预览】:
rust-htslib-master
----.cargo()
--------config(68B)
----docker()
--------Dockerfile.musl(637B)
--------config-musl-cross-make.mak(106B)
--------Dockerfile.gnu(353B)
--------README.md(584B)
----Cargo.toml(1KB)
----.github()
--------workflows()
----Cross.toml(270B)
----.gitmodules(90B)
----src()
--------utils.rs(1KB)
--------bcf()
--------errors.rs(4KB)
--------tpool.rs(2KB)
--------faidx()
--------lib.rs(4KB)
--------tbx()
--------bgzf()
--------htslib.rs(58B)
--------bam()
----test()
--------obs-cornercase.vcf(3KB)
--------test_cram.cram(2KB)
--------test.bam.bai(176B)
--------test_right.vcf.gz.tbi(100B)
--------tabix_reader()
--------bam2sam_expected.sam(2KB)
--------results()
--------bam2sam_test.bam(429B)
--------bgzip()
--------bam2sam_out.sam(2KB)
--------test_right.vcf(193B)
--------test_string.vcf(1KB)
--------test_headers.out.vcf(389B)
--------test.bcf.csi(103B)
--------test_various.out.vcf(1019B)
--------test.bam(429B)
--------test_cram.sam(1006B)
--------test_cram.fa.fai(55B)
--------test_cram.fa(384B)
--------test_different_index_name.bam(429B)
--------test_spliced_reads.bam(5KB)
--------test_headers.vcf(584B)
--------test.bcf(3KB)
--------test-info-multi-string.vcf(134KB)
--------test_cram.bam(552B)
--------test_index_build.bam(429B)
--------test-info-multi-string-number=A.vcf(134KB)
--------test_multi.bcf(3KB)
--------test_spliced_reads.bam.bai(23KB)
--------test_paired.sam(304B)
--------test_left.vcf.gz(208B)
--------test_right.vcf.gz(212B)
--------test_svlen.vcf(11KB)
--------test_left.vcf.gz.tbi(100B)
--------test_missing.vcf(826B)
--------test_left.vcf(190B)
--------test_various.vcf(847B)
----LICENSE.md(1KB)
----README.md(4KB)
----.gitignore(88B)
----CHANGELOG.md(9KB)
----hts-sys()
--------osx_prebuilt_bindings.rs(560KB)
--------Cargo.toml(2KB)
--------wrapper.c(305B)
--------src()
--------wrapper.h(862B)
--------build.rs(8KB)
--------README.md(210B)
--------linux_prebuilt_bindings.rs(329KB)
--------htslib()

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