文件名称：gwas2vcfweb:gwas2vcf的Web界面
文件大小：37KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-17 01:39:35
converter bioinformatics gwas vcf webapp
Web界面 Web界面，用于将GWAS摘要数据处理为VCF格式 安装 # get source git clone --recurse-submodules git@github.com:MRCIEU/gwas2vcfweb.git cd gwas2vcfweb # configure host # # store cromwell outputs here mkdir -p /data/gwas2vcfweb # # upload & download from here mkdir -p /data/gwas2vcfweb/data # # DB files # ## Reference FASTA mkdir -p /data/reference_genomes cd /data/reference_genomes wget ftp://gsapubftp-anonymous@ft
【文件预览】：
gwas2vcfweb-master
----Dockerfile.web(254B)
----gwas2vcf()
----Dockerfile.cromwell(464B)
----.gitmodules(82B)
----License(1KB)
----README.md(2KB)
----docker-compose.yml(936B)
----.gitignore(62B)
----app()
--------index.html(24KB)
--------download.py(2KB)
--------status.py(2KB)
--------globals.py(703B)
--------upload.py(10KB)
--------main.py(968B)
--------requirements.txt(105B)
--------gwas2vcf.wdl(6KB)
--------gwas_row_schema.py(2KB)
--------tests()