【文件属性】：
文件名称：gwas2vcfweb:gwas2vcf的Web界面
文件大小：37KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-28 07:52:55
converter bioinformatics gwas vcf webapp
Web界面
Web界面，用于将GWAS摘要数据处理为VCF格式
安装
# get source
git clone --recurse-submodules git@github.com:MRCIEU/gwas2vcfweb.git
cd gwas2vcfweb
# configure host
# # store cromwell outputs here
mkdir -p /data/gwas2vcfweb
# # upload & download from here
mkdir -p /data/gwas2vcfweb/data
# # DB files
# ## Reference FASTA
mkdir -p /data/reference_genomes
cd /data/reference_genomes
wget ftp://gsapubftp-anonymous@ft
【文件预览】：
gwas2vcfweb-master
----Dockerfile.web(254B)
----gwas2vcf()
----Dockerfile.cromwell(464B)
----.gitmodules(82B)
----License(1KB)
----README.md(2KB)
----docker-compose.yml(936B)
----.gitignore(62B)
----app()
--------index.html(24KB)
--------download.py(2KB)
--------status.py(2KB)
--------globals.py(703B)
--------upload.py(10KB)
--------main.py(968B)
--------requirements.txt(105B)
--------gwas2vcf.wdl(6KB)
--------gwas_row_schema.py(2KB)
--------tests()