文件名称:ToMMoVcf2Annovar:将ToMMo 3.5KJPNv2 vcf文件转换为Annovargenericdb格式
文件大小:7KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-22 07:47:02
Ruby
ToMMoVcf2Annovar 将ToMMo 3.5KJPNv2 vcf文件转换为Annovar genericdb格式。 vcf文件的下载站点为 变更日志 更新(180710):修复了tommo_separate_alternatives.rb中的chrX和MT的INFO列数据处理 更新(180702):为避免重复的条目,请仅删除tommo-3.5kjpnv2-20180625-af_snvall-chrX_PAR2.vcf并使用tommo-3.5kjpnv2-20180625-af_snvall-chrX_PAR3.vcf。 更多详细信息在 用法 将ToMMo的vcf文件放入./data/目录,为脚本提供适当的权限,然后运行转换脚本。 ./convert_35KJPNv2.sh 大约需要13分钟的时间。 使用iMac(Retina 5K,27英寸,2017),4.2 GHz I
【文件预览】:
ToMMoVcf2Annovar-master
----91_t_dir()
--------tommo.test_data.180709.MAF.txt(784B)
--------tommo.test_data.180709.INFO.txt(1KB)
--------tommo.test_data.180625.txt(259B)
----convert_35KJPNv2.sh(2KB)
----LICENSE(1KB)
----tommo_separate_alternatives.rb(2KB)
----README.md(5KB)
----91_tommo_separate_alternatives_test.rb(6KB)