ofGEM:带有筛选的Meta分析方法,用于识别基因水平的基因-环境相互作用

时间:2024-05-22 19:02:27
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文件名称:ofGEM:带有筛选的Meta分析方法,用于识别基因水平的基因-环境相互作用

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更新时间:2024-05-22 19:02:27

R

创业板 带有过滤的Meta分析方法,用于识别与遗传关联数据的基因水平的基因-环境相互作用 这种R软件包提供了基于基因的荟萃分析测试,该测试具有过滤功能,可以检测具有关联数据的基因与环境的相互作用(GxE),这是Wang等人提出的。 (2018)doi:10.1002 / gepi.22115。 它首先进行元过滤测试,以通过合并财团数据中的所有样本来过滤掉没有希望的SNP。 然后,它对基于综合过滤的GxE元分析(ofGEM)进行了测试,该测试将固定效应和随机效应元分析的优势与元过滤相结合。 它还可以分析来自多个种族的数据。 安装 对于来自的稳定版本: install.packages( ' ofGEM ' ) 对于开发版本(需要devtools软件包): devtools :: install_github( ' randel/ofGEM ' ) 参考 Wang,J.,Liu,Q.,P


【文件预览】:
ofGEM-master
----.gitignore(1KB)
----NAMESPACE(269B)
----R()
--------ofGEM.r(8KB)
--------sim_dat.r(854B)
--------forestplot.r(2KB)
----data()
--------sim_dat.rda(5KB)
----man()
--------sim_dat.Rd(916B)
--------ofGEM.Rd(4KB)
--------forest_plot.Rd(1KB)
----README.md(1KB)
----DESCRIPTION(979B)
----.gitattributes(378B)

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