文件名称:AnoConEly:昆虫Dscam基因内的保守性分析
文件大小:545KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-31 05:41:33
Python
阿诺康利 昆虫Dscam基因内的保守性分析Watly(at)knox.edu的Liam Ely Contact的DSCAM研究 从NCBI检索到的序列数据,可通过NCBI的BLASTN / BLAST +找到。 激发这项研究的论文: : 非常感谢Matthew Jones-Rhoades博士和Ole Foresberg博士。 用于从序列中构造这些数据的程序是Noisefinder程序。 您可以在源代码中找到该程序的文档,也可以通过使用参数<-h>运行该程序来找到该程序的文档。 要点是您转到包含要在cmd中分析的.fasta文件的目录。 然后,例如: Noisefinder2.py testgene.fasta testgene2.fasta testgene3.fasta 在同一目录中,将生成包含数据的文件(每个分析的文件一个)。 Noisefinder有两个版本-2和3
【文件预览】:
AnoConEly-master
----Noisefinder3()
--------pandaplotter.py(1KB)
--------dirchanger.py(910B)
--------timekeep.py(614B)
--------readfasta.py(1KB)
--------Readme.md(413B)
--------main.py(5KB)
----Amel_DSCAM.fasta(115KB)
----Amyelois_transitella.fasta(76KB)
----Dpers_DSCAM.fasta(23KB)
----Polistes_canadensis.fasta(66KB)
----Plots()
--------AllSeqs.pdf(141KB)
--------HymenopteraPlots.pdf(37KB)
--------LepidopteraPlots.pdf(37KB)
--------ColeopteraPlots.pdf(36KB)
--------readme.md(529B)
--------DipteraPlots.pdf(31KB)
----Papilio_machaon.fasta(63KB)
----Spodoptera_litura.fasta(65KB)
----Nicrophorus_vespilloides.fasta(50KB)
----README.md(2KB)
----Leptinotarsa_decemlineata.fasta(131KB)
----Trachymyrmex_cornetzi.fasta(77KB)
----Aethina_tumida.fasta(311KB)
----anopheles_dust.fasta(71KB)
----noisefinder2.py(6KB)
----dmel.fasta(69KB)