MSqRob:定量LC-MS蛋白质组学的可靠统计推断

时间:2024-05-29 23:37:09
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更新时间:2024-05-29 23:37:09

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MSqRob 定量LC-MS蛋白质组学的可靠统计推断。 MSqRob软件包允许用户对LC-MS蛋白质组学数据进行定量的蛋白质级统计推断。 更具体地说,我们的程序包利用了肽水平的输入数据,从而纠正了不平衡和特定肽的偏倚。 如前所述(Goeminne et al。(2015)),这种方法比将肽水平输入汇总为蛋白水平值更灵敏和更具特异性。 模型估计通过岭回归,经验贝叶斯方差估计和离群值的偏小来稳定。 当前,仅支持无标签蛋白质组学数据类型。 MSqRob Shiny App允许使用易于使用的图形用户界面,无需编程技能。 输出交互式绘图,并将结果自动导出到Excel。 作者恳请参考Goeminne等。 (2016)和Goeminne等人。 (2017)在任何形式的出版物或演示文稿中使用此软件包时。 1. MSqRob作为Windows的独立应用程序 如果您是Windows用户,只希望使用MS


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